『1巻あらすじ』nn隅々まで探索されつくした世界に、唯一残された秘境の大穴『アビス』。どこまで続くとも知れない深く巨大なその縦穴には、奇妙奇怪な生物たちが生息し、今の人類では作りえない貴重な遺物が眠っていた。アビスの不可思議に満ちた姿は人々を魅了し、冒険へと駆り立てた。そうして幾度も大穴に挑戦する冒険者たちは、次第に『探窟家』と呼ばれるようになっていく。アビスの緑に築かれた街『オース』に暮らす孤児のリコは、いつか母のような偉大な探窟家になり、アビスの謎を解き明かすことを夢見ていた。そんなある日、リコはアビスを探窟中に、少年の姿をしたロボットを拾い…？幻想と機械が入り混じる大冒険活劇、第一巻！★単行本カバー下イラスト収録★nn引用：コミックシーモア

『2巻あらすじ』nn深く潜った者を決して帰さない、呪いを湛えた大穴『アビス』。底知れぬこの秘境の大穴に、少女・リコは挑もうとしている…。偉大な探窟家であり、生き別れの母・ライザに会うために。存在するかも定かではない『奈落の底』への到達…。極めつけに無謀な挑戦だが、リコには、ひとり勝算があった。アビスの中で出会った、記憶喪失の機械人形(ルビ：ロボット)・レグ。見た目は小さな少年だが、その身体には恐るべき力を秘めている。彼と協力すれば、必ずや道は開けるはずだと…。レグもまた、自身の正体を知るため、無謀な少女を守るため、冒険に駆り立てられていくのであった…。友人たちの協力を得て、深界一層へと踏み出したリコとレグ。追っ手の影を気にしつつ、素早く、確実に潜っていく。まだ見ぬ深さに期待を募らせる彼らであったが。魔窟『アビス』は、ふたりを容赦なく飲み込んでゆく…。★単行本カバー下イラスト収録★nn引用：コミックシーモア

『3巻あらすじ』nn恐るべき呪いを秘めつつも、人々を魅了して止まない底知れぬ大穴『アビス』。母・ライザに会うべく少女・リコと機械人形・レグは、この大穴に人生をかけて挑んでいく。手探りながらも順調に探窟も進めていくリコとレグ。深界ニ層の監視基地〈シーカー・キャンプ〉で伝説の白笛『動かざるオーゼン』から厳しい指導を受けるなどしつつ、二人は徐々に穴に対する理解を深めていく——。そして舞台はついに深界三層から深界四層に・・・深くなるにつれ、この世の物とは思えぬほど凶暴になっていくモンスターに襲われて、冒険の大ピンチに陥ったリコとレグ。そんな絶体絶命の状況の中、二人の前に現れたのは…？友情と悲哀が入り混じる大冒険活劇、第三巻!!★単行本カバー下イラスト収録★nn引用：コミックシーモア

『4巻あらすじ』nnタマウガチの毒に侵され、昏睡状態に陥ってしまったリコ。nだがレグとナナチの献身的な介抱により、無事回復を遂る。nそしてナナチのアジトで再び体勢を立て直した三人は、アビスの下層を目指し、さらに過酷な冒険を続けていく——。nそんな中、六層への入り口・前線基地(イドフロント)で、三人の前に現れた少女・プルシュカ。n彼女はなんとナナチの宿敵ボンドルドの娘だった——。n必然と奇跡が入り混じる大冒険活劇、第四巻!!n★単行本カバー下イラスト収録★nn引用：コミックシーモア

『5巻あらすじ』nnさらなる深界六層を目指し、大穴『アビス』の深窟を続けるリコとレグ、そしてナナチ。n前線基地に辿り着いた三人の前に、悠然と立ちはだかったのは黎明卿・ボンドルドであった。nn死力を尽くし打倒せんとするレグに対し、ボンドルドは圧倒的な力を見せていく——。nn一方、リコ達と一緒に冒険することを切に望んでいたプルシュカ。nしかしその思いもむなしく、ボンドルドの恐ろしい実験の対象となり…。nn愛情と憎悪が入り混じる大冒険活劇、第五巻！！n★単行本カバー下イラスト収録★nn引用：コミックシーモア

『6巻あらすじ』nn大穴『アビス』の底を目指し、探窟を続けるリコとレグ、そしてナナチ。壮絶な戦いの末、宿敵ボンドルド討伐に成功する——。n白笛に身を変えた“プルシュカ”を手にし、『絶界の祭壇』に到達したリコ一行。二度と帰ってはこられないという『絶界行(ラストダイブ)』の末、ついに六層に辿り着く——。しかし、そんな彼女たちの前に出現したのは、独特の価値観を持つ“成れ果て”たちの棲む村であった——。n理性と本能が入り混じる大冒険活劇、第六巻!!n★単行本カバー下イラスト収録★n★おまけイラスト収録★　※おまけイラストは「メイドインアビス公式アンソロジー　度し難き探窟家たち」と同一の内容となっております。nn引用：コミックシーモア

『7巻あらすじ』nn深界六層に辿り着いたリコたちの前に、忽然と現れた“成れ果て村”。nそこは住人たちが独特の価値を持ち、その価値を交換することで成り立っている村であった。n村を探索し住人たちとの交流をもつ三人。nそんな中、ナナチの取った行動によりnリコは後戻りのできない絶望的な状況に巻き込まれていく——。n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア

『8巻あらすじ』nnリコ、レグ、ナナチの三人が辿り着いた深界六層“成れ果て村”。nn離れ離れになった仲間二人を探す途中、リコは村の端の『目の奥』と呼ばれる場所で、捕らわれの女性・ヴエコと知り合う。nnナナチを取り戻すべく、ファプタの素性を尋ねるリコに対し、かつての三賢・ヴエコは村の成り立ちに関わる、壮絶な過去を語り始める——。nn隊長のワズキャンのもと、過酷な冒険を続けたガンジャ隊の末路とは…!?nn欲望と諦観が入り混じる大冒険活劇、第八巻!!n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア

『9巻あらすじ』nnイルミューイの変わり果てた姿という、忌むべき過去をもった成れ果て村。囚われのナナチを救うべく、レグはファプタとともに村に戻る——。だが、村人に対する復讐心に燃える、ファプタのとった行動は…大人気ファンタジー、待望の第9巻n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア

『10巻あらすじ』nn復讐に燃えるファプタとそれを止めようとするレグ。nさらにベラフに囚われていたナナチも目を覚まし・・・様々な思惑が入り混じる「成れ果て村」編、遂に最終巻。n大人気ファンタジー待望の最新刊！！n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア

『11巻あらすじ』nnファプタの攻撃、さらには原生生物たちの侵入により、ついに崩壊した成れ果て村。nリコ、レグ、ナナチは様々な思いを胸に、その地を後にする——。nn旅への覚悟を新たにし、再び奈落の底を目指すリコたち一行。nそんな中、メイニャがある探窟家の死体を見つける——。nn勇気と杞憂が入り混じる大冒険活劇、第十一巻！！n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア

『12巻あらすじ』nn奈落の底を目指し六層を進むリコたち一行は、探窟隊『呪詛船団』に遭遇し拠点キャンプに招かれる。n団長のスラージョはリコたちと『巫女』との関わりを疑うが『試し』によってその真偽を確かめることに。n果たしてスラージョのいう『試し』とは！？n大人気ファンタジー、待望の最新刊！！n★単行本カバー下画像収録★nn引用：コミックシーモア